Pipeline de bioinformática para análise metataxonômica de crianças autistas (2022)
- Authors:
- USP affiliated author: OLIVEIRA, VICTOR GIRELLI PILOTO DE - FMRP
- School: FMRP
- Subjects: TRANSTORNO DO ESPECTRO AUTISTA; BIOINFORMÁTICA; GENÔMICA; TRATO GASTROINTESTINAL
- Language: Português
- Abstract: O Transtorno de Espectro do Autismo (TEA) é caracterizado pelo DSM-V-TR como um diverso grupo de condições caracterizado por algum grau de comprometimento social, comportamentos repetitivos e déficit nas habilidades de comunicação e linguagem. Estima-se que 2,2% da população possua algum grau de TEA. Uma comorbidade comum ao TEA são distúrbios gastrointestinais e na literatura recente, uma possível explicação para agravamento dos sintomas do TEA é a existência do brain-gut-microbiome axis, uma relação bidirecional entre o cérebro e a microbiota intestinal onde um pode causar mudanças fisiológicas no outro. O TEA também é uma condição altamente heterogênea, entretanto, dentre as comorbidades associadas à condição, os problemas gastrointestinais estão presentes entre 23% a 70% das crianças autistas. Estes problemas são frequentemente estudados no ramo de Metagenômica pela Bioinformática, com diversos artigos achando alguma relação entre as duas condições, geralmente com a diminuição da diversidade da microbiota intestinal em pessoas afetadas pelo TEA. Apesar disso, a microbiota é algo altamente heterogêneo e que varia de indivíduo para indivíduo. Utilizando uma amostra controle que possua indivíduos com TEA e pares de irmãos neurotípicos no grupo controle, espera-se controlar em parte a variabilidade entre microbiotas. Assim, propõe-se o estabelecimento de uma pipeline de Bioinformática para análise de dados de Metataxonômia intestinal para dados brutos de rRNA 16S, e a utilização desses dados para realização de agrupamentos através de técnicas de aprendizado de máquina não supervisionado. Neste estudo foram encontrados tanto achados que corroboram com a literatura quanto que a contradizem. As bactérias Bacteroidales porphyromonadaceae e Coriobacteriales coriobacteriaceae, que são descritas na literatura como menos presentes em casos de pessoas autistas, apresentam abundância alterada dependendo dapresença ou exclusão de cada par de irmão na amostra. Demais testes também apontaram para um cenário em que não há diferenças estatísticas entre as amostras usadas
- Imprenta:
- Place of publication: Ribeirão Preto
- Date published: 2022
-
ABNT
OLIVEIRA, Victor Girelli Piloto de. Pipeline de bioinformática para análise metataxonômica de crianças autistas. 2022. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação) – Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2022. Disponível em: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/0a7dc96b-f7f9-4d27-b9ce-ada4d251579a/TCC%20Victor%20Girelli.pdf. Acesso em: 27 abr. 2024. -
APA
Oliveira, V. G. P. de. (2022). Pipeline de bioinformática para análise metataxonômica de crianças autistas (Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação). Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/0a7dc96b-f7f9-4d27-b9ce-ada4d251579a/TCC%20Victor%20Girelli.pdf -
NLM
Oliveira VGP de. Pipeline de bioinformática para análise metataxonômica de crianças autistas [Internet]. 2022 ;[citado 2024 abr. 27 ] Available from: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/0a7dc96b-f7f9-4d27-b9ce-ada4d251579a/TCC%20Victor%20Girelli.pdf -
Vancouver
Oliveira VGP de. Pipeline de bioinformática para análise metataxonômica de crianças autistas [Internet]. 2022 ;[citado 2024 abr. 27 ] Available from: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/0a7dc96b-f7f9-4d27-b9ce-ada4d251579a/TCC%20Victor%20Girelli.pdf
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