Genômica comparativa de dois isolados de S. scitamineum com níveis diferentes de agressividade na doença do carvão da cana-de- açúcar (2023)
- Authors:
- USP affiliated author: FERREIRA, PEDRO FERNANDO VILANOVA - ESALQ
- School: ESALQ
- Subjects: CANA-DE-AÇÚCAR; CARVÃO (DOENÇA DE PLANTA); FUNGOS FITOPATOGÊNICOS; GENÔMICA; SEQUENCIAMENTO GENÉTICO
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: A doença do carvão da cana-de-açúcar é resultado da interação biotrófica entre o fungo basidiomiceto Sporisorium scitamineum e a planta hospedeira, a cana-de- açúcar. A doença é caracterizada por profundas mudanças no metabolismo do hospedeiro e a emissão de uma longa estrutura a partir do meristema da planta chamada de chicote, onde estão localizados os teliósporos do patógeno que serão dispersos pelo vento. Distintos genótipos de cana possuem níveis diferentes de resistência quanto à colonização do fungo. Estudos anteriores avaliaram a natureza da agressividade de dois haplótipos brasileiros do patógeno infectando plantas resistentes e suscetíveis. Resultados demonstraram que o isolado SSC04 é capaz de promover desenvolvimento precoce da doença quando comparado ao isolado SSC39, além de induzir um maior número de chicotes nas plantas infectadas. Neste projeto, foram sequenciados os genomas completos de células sexualmente compatíveis dos dois isolados, buscando elucidar o grau de polimorfismo e/ou heterozigosidade entre estes indivíduos. A análise comparativa revelou uma alta porcentagem de sintenia entre os genomas e sequências gênicas, entretanto, foram encontradas alterações estruturais associadas à região entre os loci de mating-type, onde estão localizados os genes responsáveis pela determinação sexual, essenciais para formação da hifa dicariótica, única fase infectiva do patógeno. Estas variações estruturais provavelmente foram mediadas por reminiscentes de sequências relacionadas a elementos transponíveis. Além disso, o isolado mais agressivo SSC04 apresentou maior heterozigosidade em relação aos genomas do isolado SSC39, sendo que a variação encontrada entre os haploides do isolado SSC39 se restringe, majoritariamente, aos genes de mating. Variantes de nucleotídeo único (SNVs) foram identificadas dentro da sequência codante de genes candidatos a efetores entre os dois isolados,corroborando dados da literatura
- Imprenta:
- Place of publication: Piracicaba
- Date published: 2023
-
ABNT
FERREIRA, Pedro Fernando Vilanova. Genômica comparativa de dois isolados de S. scitamineum com níveis diferentes de agressividade na doença do carvão da cana-de- açúcar. 2023. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação) – Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2023. Disponível em: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/709147ff-893b-4cd6-92de-cf0d875e19dd/TCCPedroFernandoVilanovaFerreira.pdf. Acesso em: 27 abr. 2024. -
APA
Ferreira, P. F. V. (2023). Genômica comparativa de dois isolados de S. scitamineum com níveis diferentes de agressividade na doença do carvão da cana-de- açúcar (Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/709147ff-893b-4cd6-92de-cf0d875e19dd/TCCPedroFernandoVilanovaFerreira.pdf -
NLM
Ferreira PFV. Genômica comparativa de dois isolados de S. scitamineum com níveis diferentes de agressividade na doença do carvão da cana-de- açúcar [Internet]. 2023 ;[citado 2024 abr. 27 ] Available from: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/709147ff-893b-4cd6-92de-cf0d875e19dd/TCCPedroFernandoVilanovaFerreira.pdf -
Vancouver
Ferreira PFV. Genômica comparativa de dois isolados de S. scitamineum com níveis diferentes de agressividade na doença do carvão da cana-de- açúcar [Internet]. 2023 ;[citado 2024 abr. 27 ] Available from: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/709147ff-893b-4cd6-92de-cf0d875e19dd/TCCPedroFernandoVilanovaFerreira.pdf
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