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Identificação de genes de referência adequados em PCR quantitativo em tempo real para células tronco mesenquimais endometriais de fluxo menstrual de mulheres saudáveis e com endometriose (2019)

  • Authors:
  • USP affiliated author: ZUCHERATO, VICTORIA SIMIONATTO - FMRP
  • School: FMRP
  • Subjects: ENDOMETRIOSE; MENSTRUAÇÃO; TÉCNICAS E PROCEDIMENTOS DE LABORATÓRIO; EXPRESSÃO GÊNICA
  • Keywords: eMSC de fluxo menstrual; Genes de referência estáveis; Endometriosis; eMSC of menstrual flow; Stable reference genes
  • Agências de fomento:
  • Language: Português
  • Abstract: Sugere-se que as células-tronco mesenquimais endometriais menstruais (eMSC) tenham relação com a endometriose. Atualmente, são realizados muitos estudos de expressão gênica na doença, buscando genes alvo diferencialmente expressos. É comum normalizar os dados de RTqPCR utilizando genes de referência mais estáveis. Propusemos avaliar a estabilidade de 32 genes de referência em eMSC de fluxo menstrual de mulheres com e sem endometriose para direcionar experimentos futuros. Grupo endometriose (n = 5): mulheres com diagnóstico laparoscópico de endometriose. Grupo controle (n = 5): pacientes férteis submetidas à laparoscopia para ligadura tubária, sem diagnóstico de endometriose. Nos dois grupos, as pacientes não receberam terapia hormonal por três meses antes da coleta. As eMSC foram isolados por aderência a plástico (P3), caracterizadas por citometria de fluxo, e diferenciadas em adipócitos e osteoblastos. Um total de 32 genes de referência foi avaliado por TaqMan Array Human Endongenous Controls Plate. A estabilidade dos genes foi determinada usando os algoritmos estatísticos geNorm, NormFinder, BestKeeper, delta-Ct comparativo e os dados foram compilados na ferramenta RefFinder. RefFinder explora esses programas computacionais para classificar e comparar genes de referência candidatos. Ele calcula a média geométrica dos pesos atribuídos pelos programas mencionados para a classificação final geral. Assim, entre os 32 genes avaliados, os 5 mais estáveis são respectivamente CASC3, EIF2B1, UBC, RPS17 e TFRC. Os genes mais comumente utilizados nos estudos de endometriose para esse fim, como GAPDH e ACTB, foram classificados nas posições 20 e 28, respectivamente. O número ideal de genes de referência também foi calculado pelo geNorm, em que para essas amostras, é dois. Este é o primeiro trabalho a identificar genes de referência para amostras de eMSC de mulheres com e sem endometriose. Os genes CASC3 e EIF2B1 são os genesmais estáveis nas amostras estudadas e devem ser utilizados em conjunto como normalizadores. A identificação de genes de referência é essencial para direcionar futuros estudos de RT-qPCR
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    Versão Publicada VICTÓRIA SIMIONATTO ZUCH... Direct link
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    • ABNT

      ZUCHERATO, Victoria Simionatto. Identificação de genes de referência adequados em PCR quantitativo em tempo real para células tronco mesenquimais endometriais de fluxo menstrual de mulheres saudáveis e com endometriose. 2019. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação) – Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2019. Disponível em: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/3ed0851e-b799-4306-88ac-315bbab4da72/VICT%C3%93RIA%20SIMIONATTO%20ZUCHERATO%20-%20IDENTIFICA%C3%87%C3%83O%20DE%20GENES%20DE%20REFER%C3%8ANCIA%20ADEQUADOS%20EM%20PCR%20QUANTITATIVO%20EM%20TEMPO%20REAL%20PARA%20C%C3%89LULAS%20TRONCO%20MESEN.pdf. Acesso em: 09 maio 2024.
    • APA

      Zucherato, V. S. (2019). Identificação de genes de referência adequados em PCR quantitativo em tempo real para células tronco mesenquimais endometriais de fluxo menstrual de mulheres saudáveis e com endometriose (Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação). Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/3ed0851e-b799-4306-88ac-315bbab4da72/VICT%C3%93RIA%20SIMIONATTO%20ZUCHERATO%20-%20IDENTIFICA%C3%87%C3%83O%20DE%20GENES%20DE%20REFER%C3%8ANCIA%20ADEQUADOS%20EM%20PCR%20QUANTITATIVO%20EM%20TEMPO%20REAL%20PARA%20C%C3%89LULAS%20TRONCO%20MESEN.pdf
    • NLM

      Zucherato VS. Identificação de genes de referência adequados em PCR quantitativo em tempo real para células tronco mesenquimais endometriais de fluxo menstrual de mulheres saudáveis e com endometriose [Internet]. 2019 ;[citado 2024 maio 09 ] Available from: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/3ed0851e-b799-4306-88ac-315bbab4da72/VICT%C3%93RIA%20SIMIONATTO%20ZUCHERATO%20-%20IDENTIFICA%C3%87%C3%83O%20DE%20GENES%20DE%20REFER%C3%8ANCIA%20ADEQUADOS%20EM%20PCR%20QUANTITATIVO%20EM%20TEMPO%20REAL%20PARA%20C%C3%89LULAS%20TRONCO%20MESEN.pdf
    • Vancouver

      Zucherato VS. Identificação de genes de referência adequados em PCR quantitativo em tempo real para células tronco mesenquimais endometriais de fluxo menstrual de mulheres saudáveis e com endometriose [Internet]. 2019 ;[citado 2024 maio 09 ] Available from: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/3ed0851e-b799-4306-88ac-315bbab4da72/VICT%C3%93RIA%20SIMIONATTO%20ZUCHERATO%20-%20IDENTIFICA%C3%87%C3%83O%20DE%20GENES%20DE%20REFER%C3%8ANCIA%20ADEQUADOS%20EM%20PCR%20QUANTITATIVO%20EM%20TEMPO%20REAL%20PARA%20C%C3%89LULAS%20TRONCO%20MESEN.pdf

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