Estudos de relação quantitativa entre estrutura- atividade de uma série de aminas heterocíclicas com atividade antidepressiva in vitro (2020)
- Authors:
- USP affiliated author: SOUSA, GUSTAVO HENRIQUE MARQUES - FCF
- School: FCF
- Subjects: PLANEJAMENTO DE FÁRMACOS; QUÍMICA FARMACÊUTICA; RELAÇÕES QUANTITATIVAS ENTRE ESTRUTURA QUÍMICA E ATIVIDADE BIOLÓGICA
- Language: Português
- Abstract: INTRODUÇÃO: A depressão é uma desordem do sistema nervoso central e que acomete indivíduos no mundo todo. O arsenal terapêutico atual possui características indesejadas, como a demora do tempo de ação além de diversos efeitos adversos. Nesse contexto, a quimioinformática é uma ciência que pode ser aplicada no descobrimento e otimização de moléculas promissoras no tratamento da depressão e de diversas outras doenças, se destacando metodologias como a Relação Quantitativa entre Estrutura e Atividade (QSAR). OBJETIVO: Explorar técnicas suportadas pela literatura e que visam a obtenção de modelos com capacidade de predição da atividade biológica, neste caso atividade antidepressiva observada in vitro, baseados na estrutura química dos compostos, assim como explorar suas respectivas vantagens e desvantagens. MATERIAL E MÉTODOS: A partir de compostos obtidos na literatura com atividade antidepressiva in vitro, utilizou-se um fluxograma típico de QSAR, com partição randômica da série teste e treino, validação interna e externa dos dados e métricas pertinentes nas avaliações das respectivas performances. Foram priorizados softwares gratuitos para a representação das estruturas químicas, cálculo de descritores para o todo processo de modelagem, garantindo fácil acesso à reprodutibilidade dos resultados. Para os modelos de predição de atividade, foram empregados métodos lineares e não-lineares, explorando alguns dos algoritmos utilizados na literatura como PLS, Random Forest e SVM, utilizando para tal finalidade a linguagem de programação R. Não obstante, os parâmetros farmacocinéticos foram explorados e preditos com auxílio da plataforma SwissADME. RESULTADOS: Os modelos não-lineares obtidos por Random Forest e SVM apresentaram performance bastante superior quando comparados aos modelos lineares,com destaque àqueles que foram construídos a partir de descritores mais simples e com significado químico de fácil interpretação. As métricas obtidas para os modelos relacionados à inibição dos transportadores de norepinefrina e dopamina se apresentaram adequadas para um estudo de QSAR. As propriedades farmacocinéticas preditas para as moléculas presentes nesse estudo se apresentaram promissoras no que diz respeito ao desenvolvimento de novos candidatos à fármacos. CONCLUSÃO: Entre os modelos não-lineares de dopamina e norepinefrina, aqueles obtidos por RF possuem descritores convergentes, sendo destaque descritores tridimensionais (RDF), tamanho de cadeia principal e estado eletrônico de nitrogênio presente na estrutura, além de apresentarem como característica uma baixa demanda computacional. Sugere-se que para atividade relacionada à serotonina, outras técnicas sejam empregadas, visto que neste estudo não foi possível obter um modelo adequado para predição da inibição deste receptor
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ABNT
SOUSA, Gustavo Henrique Marques. Estudos de relação quantitativa entre estrutura- atividade de uma série de aminas heterocíclicas com atividade antidepressiva in vitro. 2020. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação) – Faculdade de Ciências Farmacêuticas, Universidade de São Paulo, São Paulo, 2020. Disponível em: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/6c7a1ef3-f5ce-4048-b563-1141436bd513/3061616.pdf. Acesso em: 09 maio 2024. -
APA
Sousa, G. H. M. (2020). Estudos de relação quantitativa entre estrutura- atividade de uma série de aminas heterocíclicas com atividade antidepressiva in vitro (Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação). Faculdade de Ciências Farmacêuticas, Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/6c7a1ef3-f5ce-4048-b563-1141436bd513/3061616.pdf -
NLM
Sousa GHM. Estudos de relação quantitativa entre estrutura- atividade de uma série de aminas heterocíclicas com atividade antidepressiva in vitro [Internet]. 2020 ;[citado 2024 maio 09 ] Available from: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/6c7a1ef3-f5ce-4048-b563-1141436bd513/3061616.pdf -
Vancouver
Sousa GHM. Estudos de relação quantitativa entre estrutura- atividade de uma série de aminas heterocíclicas com atividade antidepressiva in vitro [Internet]. 2020 ;[citado 2024 maio 09 ] Available from: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/6c7a1ef3-f5ce-4048-b563-1141436bd513/3061616.pdf
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